同模式下的「CHARM 系統」(Contract of Holy Arcana Maiden 的簡稱),讓聖女的屬性會依據玩家戰績有所變化,並在對戰時可獲得「Relational Point(羈絆點數)」,增加愈多就表是聖女和玩家間的關係愈深,可使用特殊服裝配色。另外,若能在「回顧榜(Replay Board)」的「週間 Relational Point 排行」拿到前面名次的人,就能在格鬥時使用該角色的限定服裝顏色。
因為使用按鈕會有 5 個,且初始設定第 5 按鈕會在 R1 方向,與 Arc System Works 先前的作品《聖騎士之戰》、《蒼翼默示錄》的 4 鈕操作稍微有些不同,雖然多出來的功能鍵主要作為發動聖靈技能一途,不過對於不習慣這額外第 5 按鈕的玩家,推薦改用搖桿遊玩的手感會比較順。值得一提的是《聖靈之心 3》對此加入了「簡單模式(Easy)」,能將 5 鈕操作改為 4 鈕操作。
這次是自大型機台版移植自家用主機,新增內容幅度有限,但對於整體系列而言,《聖靈之心 3》追加了和 Aracana 持有同樣能力的人工聖靈「機甲聖靈(契約ガイスト)」。單一角色劇情長度較短,但因為系統在每場提供數位可對戰角色人選,全部看完一輪時間也相當可觀。戰鬥上走著 Arc System Works 連段概念,可適時活用將對手擊至空中後的導向行動系統。《聖靈之心 3》雖有提供資料安裝加速讀取功能,不過在沒安裝的狀態下遊玩,讀取速度表現仍屬平順。