經脈系統是《三國群英鬥》提供給玩家的一個穩定的實力增長渠道，玩家通過免費修鍊武將的形式，既加強了與好友的交互，又增加了武將屬性實力。

經脈系統需君主等級達到7級後開啟。每個武將都有奇經八脈，分別為督脈、任脈、衝脈、帶脈、陰維脈、陽維脈、陰蹺脈、陽蹺脈，每種經脈對應武將一項屬性。

每個經脈都可以升級，最大為50級。同時每個武將的等級還限制該武將的經脈可升級上限。

升級經脈需消耗真氣和銅錢。真氣的來源主要為在自己和好友的五行陣中修鍊。每個玩家領地都有一個五行陣，五行陣中有五個修鍊位置，玩家點擊其中任意一個位置後即可選擇自己的武將修鍊。