為了滿足不同玩家的遊戲需求，《隱龍變》特意為玩家們準備了三種難度各異的副本模式。在不同的副本模式下不僅僅是掉落，連BOSS的AI都會有極大的變化。

1.進入世界地圖後，地區標籤為紅色的就是副本區域。

2.每個副本區域都有多個副本，選擇其中一個進入就會打開副本界面。

3.副本有三種不同的模式。組隊和深淵是需要組隊才能夠進行的模式。而個人模式中，BOSS會區分為普通BOSS和隱藏BOSS。不同BOSS的出現條件會在界面右上角進行標示，同樣不同BOSS的掉落也是不同的。